RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.82□□□□□ -0.04
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SGMS1-208ENST00000608287 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.82□□□□□ -0.04
SGMS1-208ENST00000608287 IL17DQ8TAD2 202 aa14.82□□□□□ -0.04
SGMS1-208ENST00000608287 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.82□□□□□ -0.04
SGMS1-208ENST00000608287 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.82□□□□□ -0.04
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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SGMS1-208ENST00000608287 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.82□□□□□ -0.04
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SGMS1-208ENST00000608287 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 OR4A47Q6IF82 309 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 DCUN1D4Q92564 292 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 H3BMQ9 156 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 GPR31O00270 319 aa14.74□□□□□ -0.05
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