RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		H3BNX3	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		H7C2Y5	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SULT1B1	O43704	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ISG15	P05161	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATF1	P18846	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GAL	P22466	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TFPI2	P48307	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MS4A2	Q01362	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLINT1	Q14677	625 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STH	Q8IWL8	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PHB2	Q99623	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF5	Q99942	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ORC5	O43913	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2J3	O76001	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSG1	P11464	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCR9	P51686	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FLOT2	Q14254	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TBX5	Q99593	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		M0R129	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPINT2	O43291	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CIB2	O75838	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C1QB	P02746	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ALPL	P05186	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPP1	P10451	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C4BPB	P20851	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRKACG	P22612	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MC5R	P33032	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HTD2	P86397	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EFNB1	P98172	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms