RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 PLCE1Q9P212 2302 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 LCE6AA0A183 80 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 F2RL2O00254 374 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 CYB5BO43169 146 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 PDE6DO43924 150 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 CST7O76096 145 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 IGLV2-14P01704 120 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OPN1MWP04001 364 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 CRYBA1P05813 215 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 GRPP07492 148 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 CECR9P0C854 216 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 P0C879 139 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OMGP23515 440 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 CDKN1AP38936 164 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 GPR12P47775 334 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 PAX9P55771 341 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OR2B8PP59922 312 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SPCS3P61009 180 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 RAB11AP62491 216 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 WDR86Q86TI4 376 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 ZNF429Q86V71 674 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 ZNF525Q8N782 197 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OR4S2Q8NH73 311 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 Q8TCH9 128 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 DTD1Q8TEA8 209 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PR80 420 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ODAMA1E959 279 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MARCH11A6NNE9 402 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 H3BQ15 152 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 UBE2CO00762 179 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TNFSF12O43508 249 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TNFSF13O75888 250 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR2C1O95371 312 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MT-CO2P00403 227 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CGAP01215 116 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1-5P01602 117 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 IRF2P14316 349 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NQO2P16083 231 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF1AP19438 455 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 EPHA1P21709 976 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 S100PP25815 95 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PRDX2P32119 198 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 OR3A1P47881 315 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 THBS3P49746 956 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PDCD1Q15116 288 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 RTL8BQ17RB0 113 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ZNF585BQ52M93 769 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 DNLZQ5SXM8 178 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NUP37Q8NFH4 326 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ZNF488Q96MN9 340 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NGBQ9NPG2 151 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 GNG12Q9UBI6 72 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 IL19Q9UHD0 177 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 CLDN34H7C241 214 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R2P9O14990 202 aa6.63□□□□□ -1.35
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