RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PN81 502 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM235A6NFC5 223 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FCN1O00602 326 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TSC22D2O75157 780 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PROP1O75360 226 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CNIH1O95406 144 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-16P04430 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CTXN2P0C2S0 81 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 DTYMKP23919 212 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB8P28062 276 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNA7P36544 502 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GNB1P62873 340 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PSG5Q15238 335 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 RTL8BQ17RB0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PDPNQ86YL7 162 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 RAX2Q96IS3 184 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR5B12Q96R08 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 KLK15Q9H2R5 256 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 G3V3Q6 166 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A17O43808 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 B3GALNT1O75752 331 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SCO1O75880 301 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR2A4O95047 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 DIRAS3O95661 229 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CA2P00918 260 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IL5P05113 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL3P19876 107 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS7P47929 136 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 RAB9AP51151 201 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CFHR3Q02985 330 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OPCMLQ14982 345 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ACTBL2Q562R1 376 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZS49 121 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 RNF152Q8N8N0 203 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 BVESQ8NE79 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR11H1Q8NG94 326 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR2A7Q96R45 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD1Q96SE0 405 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 P2RX4Q99571 388 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GAB2Q9UQC2 676 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 VSIG4Q9Y279 399 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ETV7Q9Y603 341 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 HMSDA8MTL9 139 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TUSC2O75896 110 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SPDEFO95238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FCER2P06734 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FGF2P09038 288 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 SCAND1P57086 179 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 RAP2BP61225 183 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NDPQ00604 133 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 FXYD3Q14802 87 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LFNGQ8NES3 379 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC1AQ92747 370 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 HARBI1Q96MB7 349 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A10Q96PG2 267 aa6.49□□□□□ -1.37
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