RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	BMPR1B	O00238	502 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	OR2J3	O76001	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SDC2	P34741	201 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CBX5	P45973	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CD81	P60033	236 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	MXD1	Q05195	221 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	HAGH	Q16775	308 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	FCGR2C	P31995	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF45	Q02386	682 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	THYN1	Q9P016	225 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	LGALS9	O00182	355 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	HLA-G	P17693	338 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ARL3	P36405	182 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF773	Q6PK81	442 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	TNC	P24821	2201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF320	A2RRD8	509 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SSX5	O60225	188 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	PPY	P01298	95 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CRYGC	P07315	174 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	FOLR2	P14207	255 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	NQO2	P16083	231 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	PSMB6	P28072	239 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	TAS2R31	P59538	309 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	HERV-K104	P61576	105 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-208	ENST00000579743	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	TNFSF12	O43508	249 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	OR2C1	O95371	312 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	HPRT1	P00492	218 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	FXYD4	P59646	89 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	ERVK-16	P61578	105 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	FGF2	P09038	288 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	CBLN1	P23435	193 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	S100G	P29377	79 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75

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