RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 AMBNQ9NP70 447 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PPP5D1E7EU14 171 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 LGALS9O00182 355 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PROP1O75360 226 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV2-23P01705 113 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PRH1P02810 166 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 CRYGBP07316 175 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 MED14OSP0DP75 135 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 CBLN1P23435 193 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 ZBTB25P24278 435 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 MAP2K4P45985 399 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PRR20EP86478 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PRR20CP86479 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PRR20DP86480 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PRR20BP86481 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 PRR20AP86496 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 SVOPQ8N4V2 548 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 Q96MT0 163 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PPK0 400 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 RAB19A4D1S5 217 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 M0R1X1 148 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 IFNA4P05014 189 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 LIMS3P0CW19 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 LIMS4P0CW20 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 MFAP4P55083 255 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 Q499Y3 187 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 STPG3Q8N7X2 389 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 RNF183Q96D59 192 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM19Q96E16 107 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 HARBI1Q96MB7 349 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH2Q9P225 4427 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0A6YYH2 397 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 A6NJ64 397 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OGG1O15527 345 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR2J3O76001 311 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 NAPSAO96009 420 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GABRB1P18505 474 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 UCP1P25874 307 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SPCS3P61009 180 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF45Q02386 682 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 TNXAQ16473 311 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf32Q32M92 178 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GPHB5Q86YW7 130 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 NECAP1Q8NC96 275 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DTD1Q8TEA8 209 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PTX4Q96A99 478 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 DIABLOQ9NR28 239 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 GHRLQ9UBU3 117 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-210ENST00000578916 FBXL17Q9UF56 701 aa6.77□□□□□ -1.33
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