RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	AREG	P15514	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	MGMT	P16455	207 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	RSU1	Q15404	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	FCN2	Q15485	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	THYN1	Q9P016	225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954		A0A096LPF7	62 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954		E7EUB6	86 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	YIF1A	O95070	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	EVI2A	P22794	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	FXYD7	P58549	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	CBX3	Q13185	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954		A0A0D9SG52	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	EBAG9	O00559	213 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	SC5D	O75845	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	RASSF2	P50749	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	CDK10	Q15131	360 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LYRM1-208	ENST00000567954	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954		M0QYG6	137 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954		M0R1X1	148 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	PSMD7	P51665	324 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	CCR9	P51686	369 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	CXCR4	P61073	352 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	WFDC2	Q14508	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	NEB	P20929	6669 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	HELT	A6NFD8	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	DCTN3	O75935	186 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	NAPSA	O96009	420 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	CRYGD	P07320	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	CTSG	P08311	255 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	RRAS	P10301	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC2A5	P22732	501 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	TSPO	P30536	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	HMGN3	Q15651	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	PRR4	Q16378	134 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LYRM1-208	ENST00000567954	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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