RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566096.5

RPGRIP1L-208, Transcript of RPGRIP1 like, human

TSL 2 BASIC

Gene RPGRIP1L, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	RNF5	Q99942	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096		E9PI62	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	RASSF2	P50749	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CCR9	P51686	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	EFNB1	P98172	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	HMGN3	Q15651	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096		Q5VSD8	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GAPT	Q8N292	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	MUL1	Q969V5	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FAT1	Q14517	4588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	TSPAN4	O14817	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GPX5	O75715	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SC5D	O75845	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ATP5H	O75947	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	REG1A	P05451	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	BDKRB2	P30411	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GPR183	P32249	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CEACAM6	P40199	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	MAP2K4	P45985	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FLOT2	Q14254	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	RAB27B	O00194	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	NXPH3	O95157	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CLEC3B	P05452	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	MGMT	P16455	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FUT3	P21217	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	PPP3R1	P63098	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CBX3	Q13185	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	PRSS8	Q16651	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	POMP	Q9Y244	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPGRIP1L-208	ENST00000566096	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms