RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 CATR1Q13166 79 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 KLRD1Q13241 179 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 GUSBP1Q15486 140 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 DUSP5Q16690 384 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SBSNQ6UWP8 590 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 C1orf174Q8IYL3 243 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 LRTM2Q8N967 370 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR51T1Q8NGJ9 327 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR51G1Q8NGK1 321 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF675Q8TD23 568 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 MS4A6EQ96DS6 147 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SDSLQ96GA7 329 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 NMRAL1Q9HBL8 299 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SH2D2AQ9NP31 389 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 TMEM106BQ9NUM4 274 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 HRASLS2Q9NWW9 162 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 CLCF1Q9UBD9 225 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 IL36AQ9UHA7 158 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ASF1AQ9Y294 204 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ALKQ9UM73 1620 aa2.93□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 MYO10Q9HD67 2058 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 CUL7Q14999 1698 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 A0A0D9SFI3 127 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 A6NDN8 102 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 A8MU10 97 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 PRSS46E5RG02 174 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 K7ENP7 123 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 PLPP1O14494 284 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SH2D1BO14796 132 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 DIRAS1O95057 198 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 UBL3O95164 117 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 NDUFA7O95182 113 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 MT-ATP8P03928 68 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 CNTFRP26992 372 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 LEPP41159 167 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR1D5P58170 312 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 LCN6P62502 163 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 RPL31P62899 125 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF146Q15072 292 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 PMVKQ15126 192 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 C15orf32Q32M92 178 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SPATA45Q537H7 98 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF684Q5T5D7 378 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 Q5XG85 94 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 Q6Q795 121 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 RASL11AQ6T310 242 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZDHHC22Q8N966 263 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF709Q8N972 641 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 Q8N976 141 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZIC4Q8N9L1 334 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 TMEM229BQ8NBD8 167 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 ZNF740Q8NDX6 193 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR4F17Q8NGA8 305 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR5AR1Q8NGP9 310 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SLC37A2Q8TED4 501 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 DDIT4LQ96D03 193 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 OR4F4Q96R69 305 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 MCHR1Q99705 422 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 IKZF5Q9H5V7 419 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 KCNJ16Q9NPI9 418 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 RPRMQ9NS64 109 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 INSIG2Q9Y5U4 225 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 MYO3AQ8NEV4 1616 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 USP32Q8NFA0 1604 aa2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
GDE1-202ENST00000563645 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms