RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560207.1

RABGGTA-215, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM219AQ8IW50 185 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ARPC1AQ92747 370 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 IL22RA2Q969J5 263 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CITED1Q99966 193 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 NAA60Q9H7X0 242 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ZFP57Q9NU63 452 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 STAB1Q9NY15 2570 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 H3BUA1 57 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 LYRM1O43325 122 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 FBXO24O75426 580 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 UPK1BO75841 260 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 NDUFB6O95139 128 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 BRI3O95415 125 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CA2P00918 260 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 FOXE3Q13461 319 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 OR4A47Q6IF82 309 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 PRNDQ9UKY0 176 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CYB5BO43169 146 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 S1PR2O95136 353 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CDS2O95674 445 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 DHFRP00374 187 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 IGHG4P01861 327 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RAB25P57735 213 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ASAH1Q13510 395 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TNXAQ16473 311 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TRIM16LQ309B1 348 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF585BQ52M93 769 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM65Q6PI78 240 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 Q6ZS46 218 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RNF152Q8N8N0 203 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 PARP11Q9NR21 331 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM140Q9NV12 185 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 M0QZ24 198 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 UPK2O00526 184 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 FCN1O00602 326 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ATP6V0E1O15342 81 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 KRASP01116 189 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 AKR1C4P17516 323 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 HLA-GP17693 338 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 PI3P19957 117 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM209BQ5JX69 171 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF695Q8IW36 515 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 OR5B3Q8NH48 314 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SEC22AQ96IW7 307 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM56Q96MV1 263 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CLCC1Q96S66 551 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 GPHA2Q96T91 129 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 PHB2Q99623 299 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 OR5AC1P0C628 307 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 AKR1C2P52895 323 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 GNB1P62873 340 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CD83Q01151 205 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 CFHR3Q02985 330 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 SSX9Q7RTT3 188 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNF429Q86V71 674 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 LGI3Q8N145 548 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 OR4A16Q8NH70 328 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTA-215ENST00000560207 TP53RKQ96S44 253 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms