RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557261.1

FOXN3-215, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 4

Gene FOXN3, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ODAM	A1E959	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SSNA1	O43805	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SFT2D2	O95562	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CD8A	P01732	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	GZMH	P20718	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	S100G	P29377	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	FCGR2C	P31995	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	GABRA2	P47869	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	FCN2	Q15485	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261		Q6ZVQ6	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	GALM	Q96C23	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	LIME1	Q9H400	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261		H0Y980	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	GPR31	O00270	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	RP2	O75695	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	RBP4	P02753	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SCT	P09683	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CGB3	P0DN86	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CGB7	P0DN87	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	AADAC	P22760	399 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CD34	P28906	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	FHIT	P49789	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SEC61G	P60059	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CCL8	P80075	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TLE4	Q04727	773 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	FGL1	Q08830	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	NMES1	Q9C002	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FOXN3-215	ENST00000557261	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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