RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0B4J2E0 115 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GX12 115 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LYZL6O75951 148 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CCL3P10147 92 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM258P61165 79 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CT83Q5H943 113 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00596Q86U02 117 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FAM219AQ8IW50 185 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 KCNS1Q96KK3 526 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CHST6Q9GZX3 395 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf118A6NHY6 69 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CDC42EP2O14613 210 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MLNRO43193 412 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM50AO95807 157 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MVDP53602 400 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CCL17Q92583 94 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RAB40CQ96S21 281 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RS1O15537 224 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF737O75373 536 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CD3DP04234 171 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 EMC6Q9BV81 110 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GNB4Q9HAV0 340 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 B9D1Q9UPM9 204 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FOXS1O43638 330 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 EML2O95834 649 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PTGER1P34995 402 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PLPP2O43688 288 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 EPPINO95925 133 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CD1AP06126 327 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 EMDP50402 254 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM33P57088 247 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FXYD4P59646 89 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 AQP10Q96PS8 301 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A10O95528 541 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MOSP00540 346 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 COX6CP09669 75 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC75AQ8NAA5 344 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WV48 116 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HERVK_113P61574 105 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MOB3BQ86TA1 216 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 STPG4Q8N801 248 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FAM186AA6NE01 2351 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 KNTC1P50748 2209 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMPRSS2O15393 492 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GFRA1P56159 465 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZP4Q12836 540 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GGTLC2Q14390 218 aa5.39□□□□□ -1.55
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