RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 METTL21EPA6NDL7 271 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 IFITM5A6NNB3 132 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 HSD17B6O14756 317 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RBBP9O75884 186 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 IFNA17P01571 189 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 MYOD1P15172 320 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 HLA-GP17693 338 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CPT2P23786 658 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 S100A2P29034 98 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 MAS1LP35410 378 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CAV2P51636 162 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 ERVK11-1P61568 191 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 C4orf46Q504U0 113 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TMEM42Q69YG0 159 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 LFNGQ8NES3 379 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 ATG5Q9H1Y0 275 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TCF19Q9Y242 345 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PN81 502 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 J3QR06 171 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 FSHBP01225 129 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 AKAIN1P0CW23 69 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SRMP19623 302 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CHRNA7P36544 502 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 Q6P435 159 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TMEM231Q9H6L2 316 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 MOB1AQ9H8S9 216 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RHOFQ9HBH0 211 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TPSG1Q9NRR2 321 aa6□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TMEM235A6NFC5 223 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 REG1AP05451 166 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SFTA3P0C7M3 94 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 DDTP30046 118 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 BRS3P32247 399 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SCAND1P57086 179 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 BAP18Q8IXM2 172 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RHOVQ96L33 236 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SLC25A17O43808 307 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TUSC2O75896 110 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CD5P06127 495 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 PRRX1P54821 245 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 ACTBP60709 375 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SYS1Q8N2H4 156 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SPSB1Q96BD6 273 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 AJUBAQ96IF1 538 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 GFI1Q99684 422 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 PSMB11A5LHX3 300 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 MEGF11A6BM72 1044 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 TSTD3H0UI37 97 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 M0R1X1 148 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 MPPED1O15442 326 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SPINT2O43291 252 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 NXPH3O95157 252 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 IGKV1-16P04430 117 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 OR4E1P0C645 316 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SPINK9Q5DT21 86 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 GAB2Q9UQC2 676 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 NSG2Q9Y328 171 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 V9GY05 133 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 NACAE9PAV3 2078 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 A0A087X0M5 115 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GX30 115 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 CD34P28906 385 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 ECI1P42126 302 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-212ENST00000548567 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms