RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	GNG12	Q9UBI6	72 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	RELN	P78509	3460 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	RND2	P52198	227 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	MSMO1	Q15800	293 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01560	Q8TB33	94 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	JPT1	Q9UK76	154 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		12.97	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A087X0M5	115 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GX30	115 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC30	A6NM36	301 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	RAMP3	O60896	148 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	MORN2	Q502X0	79 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	GAB2	Q9UQC2	676 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	PHOX2A	O14813	284 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	TCAP	O15273	167 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1D-33	P01593	117 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1-33	P01594	117 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	LOXL3	P58215	753 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	CALY	Q9NYX4	217 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	VAX2	Q9UIW0	290 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		12.96	□□□□□ -0.33
GRSF1-208	ENST00000545193	F2RL2	O00254	374 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CGB3	P0DN86	165 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CGB7	P0DN87	165 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CATR1	Q13166	79 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	LY6D	Q14210	128 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	FGFRL1	Q8N441	504 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	LHX4	Q969G2	390 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		12.96	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	ATRX	P46100	2492 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	USF3	Q68DE3	2245 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	YPEL1	O60688	119 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CD3E	P07766	207 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	YPEL2	Q96QA6	119 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	PRORY	Q9H606	182 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	DSCAM	O60469	2012 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN1	O95832	211 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CD81	P60033	236 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	HBG1	P69891	147 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	HBG2	P69892	147 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC25A22	Q9H936	323 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	DYSF	O75923	2080 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	ROS1	P08922	2347 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	SMCO3	A2RU48	225 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	C17orf98	A8MV24	154 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFA4	P12838	97 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CDSN	Q15517	529 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	OPN1MW	P04001	364 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00205	P59089	165 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	CCL17	Q92583	94 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.94	□□□□□ -0.34
GRSF1-208	ENST00000545193	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		12.94	□□□□□ -0.34

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