RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 YIPF5Q969M3 257 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SPACA5Q96QH8 159 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RARRES2Q99969 163 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 Q9UF83 564 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TACC2O95359 2948 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ROS1P08922 2347 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GGT3PA6NGU5 568 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CD300LBA8K4G0 201 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FAM25AB3EWG3 89 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FAM25CB3EWG5 89 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FAM25GB3EWG6 89 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PTTG1O95997 202 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NRASP01111 189 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MELTFP08582 738 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CECR9P0C854 216 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 APLNRP35414 380 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CA7P43166 264 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CBX5P45973 191 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR3A4PP47883 348 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RAB7AP51149 207 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R20P59543 309 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R60P59551 318 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RAB14P61106 215 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RAB31Q13636 194 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LY6DQ14210 128 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 BSXQ3C1V8 233 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PYDC2Q56P42 97 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR10K2Q6IF99 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 STPG4Q8N801 248 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 S100PBPQ96BU1 408 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CHIAQ9BZP6 476 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 ORC5O43913 435 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1D-12P01611 117 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CD55P08174 381 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 UBBP0CG47 229 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PTHLHP12272 177 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SPNP16150 400 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZP3P21754 424 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 BTCP35070 178 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TALDO1P37837 337 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ERVS71-1P61550 626 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1CBP62140 327 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PSG7Q13046 419 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF876PQ49A33 203 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 HACD4Q5VWC8 232 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CALHM1Q8IU99 346 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP82Q8N141 532 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LFNGQ8NES3 379 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PXT1Q8NFP0 134 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ENKURQ8TC29 256 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF488Q96MN9 340 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TM2D1Q9BX74 207 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 THYN1Q9P016 225 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MLXQ9UH92 298 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CACNA1BQ00975 2339 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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