RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 GABARAPL2P60520 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB114Q30KQ6 69 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 C2orf70A6NJV1 201 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 OR11H12B2RN74 326 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 LGALS9O00182 355 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF320A2RRD8 509 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF785A8K8V0 405 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 IGLV2-14P01704 120 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CD7P09564 240 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL3P36405 182 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SSX9Q7RTT3 188 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 GPHB5Q86YW7 130 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB125Q8N687 156 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 FCGR1BQ92637 280 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX22C9J3V5 150 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 JTBO76095 146 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF735P0CB33 412 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMB6P28072 239 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFB8O95169 186 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3-23P01764 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CBLN1P23435 193 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4A47Q6IF82 309 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 BEST4Q8NFU0 473 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4A5Q8NH83 315 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RETNQ9HD89 108 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TNCP24821 2201 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TENM2Q9NT68 2774 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYGCP07315 174 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 FCGR2CP31995 323 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 SPARTQ8N0X7 666 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CXorf58Q96LI9 332 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 Q9H521 79 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 E7EUB6 86 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFSF12O43508 249 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 SSX5O60225 188 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 AREGP15514 252 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-GP17693 338 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CATR1Q13166 79 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 MSMO1Q15800 293 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 DIABLOQ9NR28 239 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 BET1LQ9NYM9 111 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 THYN1Q9P016 225 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 S4R3C0 116 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CYB5BO43169 146 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC3BP05452 202 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CTRB1P17538 263 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 SDC2P34741 201 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 SCAND1P57086 179 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 MXD1Q05195 221 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 IDNKQ5T6J7 187 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-220ENST00000511663 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms