RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 L3HYPDHQ96EM0 354 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RBP7Q96R05 134 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 OR4C12Q96R67 309 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 CGREF1Q99674 301 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RARRES2Q99969 163 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf50Q9BV19 199 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 CLN6Q9NWW5 311 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 GGT3PA6NGU5 568 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 A6NJ64 397 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 PHBP35232 272 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 TGM4P49221 684 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 CAV3P56539 151 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2G2P60604 165 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 NAA20P61599 178 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 LEMD1Q68G75 181 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 LZICQ8WZA0 190 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 SEH1LQ96EE3 360 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 SRRQ9GZT4 340 aa3.19□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf90A8MZG2 172 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 SMLR1H3BR10 107 aa3.18□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 TFF1P04155 84 aa3.18□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 TMUB2Q71RG4 321 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 NECAP1Q8NC96 275 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 DCUN1D4Q92564 292 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RPEQ96AT9 228 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 GAFA1Q96PS6 74 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 CIB1Q99828 191 aa3.18□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 MICU1Q9BPX6 476 aa3.18□□□□□ -1.9
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