RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SLIT2O94813 1529 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 DIP2AQ14689 1571 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 MED14O60244 1454 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 C9JCJ5 164 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CD24P25063 80 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 NAA20P61599 178 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 LCE1CQ5T751 118 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T27Q8NH04 317 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 EVC2Q86UK5 1308 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ATP10BO94823 1461 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WUU8 490 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 LY6LH3BQJ8 138 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 NPYP01303 97 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 FGF13Q92913 245 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 SFRP2Q96HF1 295 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GUCA1BQ9UMX6 200 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 CNTLNQ9NXG0 1405 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 KIF14Q15058 1648 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA9Q8IUA7 1624 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf86A6NJI1 115 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf74A8MZ97 194 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK1O00180 336 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 GNRH2O43555 120 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 UCHL1P09936 223 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF550Q7Z398 422 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 PECRQ9BY49 303 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-212ENST00000491302 TCL1AP56279 114 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R20P59543 309 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 NUP188Q5SRE5 1749 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 GPHB5Q86YW7 130 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR4X1Q8NH49 305 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 NMNAT3Q96T66 252 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 Q9BRP9 147 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 A2MP01023 1474 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 MYO3BQ8WXR4 1341 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 MROH2AA6NES4 1674 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ITSN2Q9NZM3 1697 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC1P33527 1531 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PQD3 144 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC10F2Z333 226 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 COX7A2LO14548 114 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO1A2P46721 670 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 REG1BP48304 166 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-212ENST00000491302 PRDX4Q13162 271 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 IMPG1Q17R60 797 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35F6Q8N357 371 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 OR51I1Q9H343 314 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 AK3Q9UIJ7 227 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 DEPDC5O75140 1603 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K1Q13233 1512 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB6Q5THR3 1501 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-212ENST00000491302 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.38□□□□□ -1.87
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