RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 PPOXP50336 477 aa11.34□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.34□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.34□□□□□ -0.59
HDLBP-241ENST00000487169 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 AP4M1O00189 453 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 REG1AP05451 166 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 MFAP4P55083 255 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 AQP10Q96PS8 301 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TP53RKQ96S44 253 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF137PP52743 207 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 WBP1Q96G27 269 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 HKR1P10072 659 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 RPL39P5Q59GN2 51 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 AUP1Q9Y679 476 aa11.33□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 PROB1E7EW31 1015 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ID1P41134 155 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM187Q14656 261 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 Q1RN00 199 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 NPIPB3Q92617 1050 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 A8MXK9 166 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 A8MWL6 223 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 C16orf92Q96LL3 132 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 METTL26Q96S19 204 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 DPM3Q9P2X0 92 aa11.32□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 PINLYPA6NC86 204 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf100A8MU93 164 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 MST1P26927 711 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 FXYD3Q14802 87 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 GUCA2BQ16661 112 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 STPG3Q8N7X2 389 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 POC1AQ8NBT0 407 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TM2D1Q9BX74 207 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PS18 150 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 HAX1O00165 279 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 M0R2Z0 102 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.31□□□□□ -0.6
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HDLBP-241ENST00000487169 TEX29Q8N6K0 151 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 CGB1A6NKQ9 187 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 MGPP08493 103 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 NUBP1P53384 320 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TM4SF20Q53R12 229 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 LRP11Q86VZ4 500 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.31□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 H0YL77 283 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ISLRO14498 428 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 EFNA2O43921 213 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 LYPD3O95274 346 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 C8orf88P0DMB2 117 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 CCL19Q99731 98 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.3□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 GAS1P54826 345 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 LY6DQ14210 128 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087WV48 116 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 LCN2P80188 198 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 FAM209BQ5JX69 171 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM8Q96KF7 97 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 PRO1933Q9H354 126 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 PRR32B1ATL7 298 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 H3BTX0 84 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 G0S2P27469 103 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.29□□□□□ -0.6
HDLBP-241ENST00000487169 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
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