RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C11orf52Q96A22 123 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 NUS1Q96E22 293 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OSTCQ9NRP0 149 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 JPT1Q9UK76 154 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 A4D1N5 150 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A20A6NK97 555 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C4orf51C9J302 202 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C11orf94C9JXX5 98 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 HRKO00198 91 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 FOXS1O43638 330 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SYNGR2O43760 224 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 MPDU1O75352 247 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CST7O76096 145 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-19P01714 112 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-1P01715 115 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PRNPP04156 253 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PSG2P11465 335 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 S100A7P31151 101 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 DRD3P35462 400 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 EGR4Q05215 589 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CST6Q15828 149 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 VWC2Q2TAL6 325 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ERASQ7Z444 233 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TSKUQ8WUA8 353 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 NEUROG1Q92886 237 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C5orf30Q96GV9 206 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 AJUBAQ96IF1 538 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 VSTM2LQ96N03 204 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GCM1Q9NP62 436 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PEMTQ9UBM1 199 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 A0A0C4DFX4 3053 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PI4KAP42356 2102 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 A0A0J9YY10 115 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GX78 115 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PQD3 144 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 hADV38S2A0JD32 116 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GRIFINA4D1Z8 144 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 FAM181BA6NEQ2 426 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 C2orf70A6NJV1 201 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SNURFLB1AK76 121 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SH2D1BO14796 132 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 WIPF1O43516 503 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GNG7O60262 68 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SAP30O75446 220 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR2J3O76001 311 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 MPZL1O95297 269 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TMEM50AO95807 157 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PPYP01298 95 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 STAG3L2P0CL84 134 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CCL2P13500 99 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GCSHP23434 173 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GPR183P32249 361 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SSTR5P35346 364 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 METAP1P53582 386 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TCL1AP56279 114 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TGFBR3Q03167 851 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 KISS1Q15726 138 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SP6Q3SY56 376 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TMEM97Q5BJF2 176 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 UEVLDQ8IX04 471 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR2Z1Q8NG97 314 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR4A16Q8NH70 328 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SARAFQ96BY9 339 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms