RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 ZNF253O75346 499 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 NEURL1O76050 574 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 PLXNA2O75051 1894 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 A0A0G2JLM5 398 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 M0R2Z0 102 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TM2D1Q9BX74 207 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 DEDDO75618 318 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 THBDP07204 575 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 PSG5Q15238 335 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 POC1AQ8NBT0 407 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 RRN3P1Q2M238 152 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 GFI1Q99684 422 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ACACAQ13085 2346 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 S1PR2O95136 353 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CXorf1O96002 111 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 OR2J3O76001 311 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CACNA1HO95180 2353 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TRGC1P0CF51 173 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TSPOP30536 169 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 BTCP35070 178 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TM4SF20Q53R12 229 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 LCN2P80188 198 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 C5orf17Q8NAS9 161 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 SLC25A17O43808 307 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ATP6V0CP27449 155 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 NHLH1Q02575 133 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 DDB2Q92466 427 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 SLC25A28Q96A46 364 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 C16orf92Q96LL3 132 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 PINLYPA6NC86 204 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 UCP3P55916 312 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 RIGQ13278 110 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 BMPERQ8N8U9 685 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CCL1P22362 96 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 SPATA45Q537H7 98 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 GPHA2Q96T91 129 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 GBF1Q92538 1859 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 K7ENP7 123 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 GNLYP22749 145 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZS92 163 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.52□□□□□ -0.56
NISCH-207ENST00000479054 CD1BP29016 333 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 FXYD3Q14802 87 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SYT8Q8NBV8 401 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 AQP10Q96PS8 301 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 C11orf94C9JXX5 98 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 P01737 135 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 ZNF735P0CB33 412 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 A6NDN8 102 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PDE6DO43924 150 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PITX3O75364 302 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms