RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 COX7A2LO14548 114 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5G3P0C626 314 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM228BP0C875 321 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R2P41236 205 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP2K4P45985 399 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GABRA2P47869 451 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GABRA4P48169 554 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB4BP61018 213 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GNA12Q03113 381 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FABP9Q0Z7S8 132 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB125Q8N687 156 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP19Q96LK0 163 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 AK3Q9UIJ7 227 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL5AQ9Y689 179 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF24Q5T7B8 1368 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ALKQ9UM73 1620 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PLXNB1O43157 2135 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF532Q9HCE3 1301 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 NCOA1Q15788 1441 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1B0GV50 99 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FADS1O60427 444 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 LYPLA2O95372 231 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINA1P01009 418 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS17P08708 135 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CBR1P16152 277 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GZMHP20718 246 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEA12P43365 314 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SULT1A1P50225 295 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ALX1Q15699 326 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM201AQ5SY85 155 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PACRGLQ8N7B6 248 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDND2Q8NHS1 167 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SGMS2Q8NHU3 365 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PRRT1Q99946 306 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CXorf21Q9HAI6 301 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR84Q9NQS5 396 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CCL26Q9Y258 94 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 COQ4Q9Y3A0 265 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MMACHCQ9Y4U1 282 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 IFT140Q96RY7 1462 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PKD1L2Q7Z442 2459 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2B3O76000 313 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4E1P0C645 316 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CD24P25063 80 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPZBP47756 277 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 XCL1P47992 114 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4D2P58180 307 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVS71-1P61550 626 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXF1Q12946 379 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 PMAIP1Q13794 54 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 POU6F1Q14863 301 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM86BQ8N661 226 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 OR51D1Q8NGF3 324 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 OR13C8Q8NGS7 320 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC35B4Q969S0 331 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM96AQ9H5X1 160 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS29Q9UBQ0 182 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 ANGPT4Q9Y264 503 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MROH2BQ7Z745 1585 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-207ENST00000470201 CIAO1O76071 339 aa2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms