RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR31O00270 319 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 CTDSP2O14595 271 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RAMP3O60896 148 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RLN1P04808 185 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 IFNA6P05013 189 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TBPP20226 339 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 MAS1LP35410 378 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TAS2R31P59538 309 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SSX9Q7RTT3 188 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52I2Q8NH67 350 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ABHD1Q96SE0 405 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 COA4Q9NYJ1 87 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 KLK11Q9UBX7 282 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 GABARAPH6UMI1 98 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 APELAP0DMC3 54 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 NQO2P16083 231 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4A5Q8NH83 315 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 HRASLSQ9HDD0 168 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 BET1LQ9NYM9 111 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 COMMD9Q9P000 198 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01619G3V211 115 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 M0QYG6 137 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 BRI3O95415 125 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3-11P01762 117 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 OR9G9P0C7N8 305 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 F2RP25116 425 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 UCP3P55916 312 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TAS2R19P59542 299 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVK-16P61578 105 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 IL18Q14116 193 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4A47Q6IF82 309 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SORL1Q92673 2214 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 S1PR2O95136 353 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 CD3DP04234 171 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 POU2AF1Q16633 256 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 PHLDA2Q53GA4 152 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 MCFD2Q8NI22 146 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 USMG5Q96IX5 58 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WW49 117 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 DPPA5A6NC42 116 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 PGAM2P15259 253 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 HLA-GP17693 338 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 DGCR2P98153 550 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM140Q9NV12 185 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCH11A6NNE9 402 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 OVOL1O14753 267 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 CTDSPLO15194 276 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB3DO95716 219 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 CD74P04233 296 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 LPAR6P43657 344 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 MRAPQ8TCY5 172 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP1-205ENST00000466097 HMX3A6NHT5 357 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM223BA6NKX1 122 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms