RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465962.1

TTC21A-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21A, human

TSL 3

Gene TTC21A, Length 440 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21A-208	ENST00000465962	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962		Q9N2K0	584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	CTDSP2	O14595	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RAB29	O14966	203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	BET1	O15155	118 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	CPE	P16870	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SRM	P19623	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TGFBR1	P36897	503 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	HTR2B	P41595	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	INSL3	P51460	131 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	FABP5	Q01469	135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PTX4	Q96A99	478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PECR	Q9BY49	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	CST11	Q9H112	138 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962		A0A0B4J203	849 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	LCE6A	A0A183	80 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SLC17A2	O00624	439 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SLC25A17	O43808	307 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	DHFR	P00374	187 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	UBB	P0CG47	229 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	APELA	P0DMC3	54 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	CEACAM6	P40199	344 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	VEGFC	P49767	419 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	OR10A3	P58181	314 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TPPP2	P59282	170 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TPBG	Q13641	420 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TRAM1	Q15629	374 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ZNF79	Q15937	498 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SSX1	Q16384	188 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	BAK1	Q16611	211 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962		Q8N402	240 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	DDB2	Q92466	427 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	UFD1	Q92890	307 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RETN	Q9HD89	108 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTC21A-208	ENST00000465962	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms