RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 Q8N1Y9 231 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 OR4A5Q8NH83 315 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 YIPF6Q96EC8 236 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ZMAT4Q9H898 229 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 BET1LQ9NYM9 111 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 PEMTQ9UBM1 199 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 HMX3A6NHT5 357 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TEX22C9J3V5 150 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 E7EUB6 86 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 C3orf84H3BNL1 204 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TNFAIP8O95379 198 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 HPRT1P00492 218 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV12-3P01733 135 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 PRH1P02810 166 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 FGF2P09038 288 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF735P0CB33 412 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 PTHLHP12272 177 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 NQO2P16083 231 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 HLA-GP17693 338 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 NAT1P18440 290 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R31P59538 309 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF45Q02386 682 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 CATR1Q13166 79 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 POU2AF1Q16633 256 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 CADM3Q8N126 398 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 Q8N402 240 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 CMTM3Q96MX0 182 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 IFT46Q9NQC8 304 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 LGALS9O00182 355 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 BMPR1BO00238 502 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SULT1C2O00338 296 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 UPK2O00526 184 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TNFSF12O43508 249 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 OR2J3O76001 311 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 CTRB1P17538 263 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 PSMB6P28072 239 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 GNRHRP30968 328 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS3P35030 304 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 RFX2P48378 723 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R46P59540 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R20P59543 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 FXYD4P59646 89 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 HERV-K104P61576 105 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 DEFA5Q01523 94 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 C15orf32Q32M92 178 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 OR4A47Q6IF82 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 LCN12Q6JVE5 192 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SSX9Q7RTT3 188 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 GPHB5Q86YW7 130 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 RCHY1Q96PM5 261 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 GPHA2Q96T91 129 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 EHFQ9NZC4 300 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GW64 132 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRF-210ENST00000463041 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.53□□□□□ -1.52
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