RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444878.5

RBM39-216, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,124 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-216	ENST00000444878	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	DVL1	O14640	695 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	HFE	Q30201	348 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	NDUFA2	O43678	99 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	HRAS	P01112	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	B2M	P61769	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	GNB2	P62879	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	HNF4G	Q14541	408 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	HAGH	Q16775	308 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	LRBA	P50851	2863 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-216	ENST00000444878	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	SIAH2	O43255	324 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	IFNA10	P01566	189 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	FGF7	P21781	194 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	CDSN	Q15517	529 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	OR4A47	Q6IF82	309 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	UBE2C	O00762	179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	SLC25A17	O43808	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ARG1	P05089	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	TXN2	Q99757	166 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878		A0A0U1RQK1	487 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	LY6D	Q14210	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	TFF3	Q07654	80 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878		M0R036	132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	MB	P02144	154 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ICAM4	Q14773	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878		H7C2Y5	167 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	RRH	O14718	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-216	ENST00000444878	APOA2	P02652	100 aa		11.17	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms