RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 HES7Q9BYE0 225 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 IFITM10A6NMD0 228 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RD3LP0DJH9 198 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MYOD1P15172 320 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 LEPP41159 167 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 INSL4Q14641 139 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MUC15Q8N387 334 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TRGV9Q99603 122 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TINAGQ9UJW2 476 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CIDEAO60543 219 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-9P01782 118 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 AMBPP02760 352 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RNF138Q8WVD3 245 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 FBXO17Q96EF6 278 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ST20Q9HBF5 79 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SEC11AP67812 179 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 Q8TCH9 128 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NABP2Q9BQ15 211 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 VPS25Q9BRG1 176 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PARLQ9H300 379 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 K7EMI3 77 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 LYZL6O75951 148 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TYMSP04818 313 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 FABP2P12104 132 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 STPG1Q5TH74 334 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SGK494Q96LW2 274 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DPM3Q9P2X0 92 aa6.03□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MGAMO43451 1857 aa6.02□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PLXNA2O75051 1894 aa6.02□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 HRKO00198 91 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF250P15622 560 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 RND2P52198 227 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TCL1AP56279 114 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 DPF1Q92782 380 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 JMJD8Q96S16 334 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF492Q9P255 531 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 OVOL1O14753 267 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LHX2P50458 406 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 QRFPP83859 136 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00311Q8N616 119 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 E9PLN8 166 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TMPRSS2O15393 492 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LEPROTL1O95214 131 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LMO1P25800 156 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 AMELYQ99218 206 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TIMP4Q99727 224 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 PTPRDP23468 1912 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 OR4C46A6NHA9 309 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 H3BP45 60 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 GATA3P23771 443 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 GATA4P43694 442 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 DLX1P56177 255 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 DLX6P56179 175 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 C3AR1Q16581 482 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TBR1Q16650 682 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 SPINK14Q6IE38 97 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 NECAP1Q8NC96 275 aa6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 CCL4P13236 92 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ATP5G2Q06055 141 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 LEMD1Q68G75 181 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 GLRX5Q86SX6 157 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.01□□□□□ -1.45
ALMS1-201ENST00000423048 ARPC1AQ92747 370 aa6.01□□□□□ -1.45
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