RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-203ENST00000409212 KLK2P20151 261 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 BSPH1Q075Z2 132 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CCL19Q99731 98 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DLX1P56177 255 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DOCK6Q96HP0 2047 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 REG1AP05451 166 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CXorf65A6NEN9 183 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 H0YL77 283 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SYT8Q8NBV8 401 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 WBP1Q96G27 269 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CFHR1Q03591 330 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 C2orf68Q2NKX9 166 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GGACTQ9BVM4 153 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NPPCP23582 126 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LY6EQ16553 131 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 C17orf100A8MU93 164 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CA2P00918 260 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AREGP15514 252 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PET117Q6UWS5 81 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DDB2Q92466 427 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DIRC3C9JPN6 131 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 M0QZK8 103 aa13.43□□□□□ -0.26
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SH3BP4-203ENST00000409212 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CRYBB3P26998 211 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CA7P43166 264 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DEPPQ9NTK1 212 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM250H0YL14 139 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CCL1P22362 96 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM177Q53S58 311 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 VN1R17PQ8TDU5 208 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CKS2P33552 79 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 IFITM2Q01629 132 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 IFITM10A6NMD0 228 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TRGC2P03986 189 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AGAP20933 346 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RARRES2Q99969 163 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GCGP01275 180 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GCHFRP30047 84 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CD59P13987 128 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RELBQ01201 579 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM201AQ5SY85 155 aa13.42□□□□□ -0.26
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SH3BP4-203ENST00000409212 PSMB2P49721 201 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RPRMQ9NS64 109 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF16Q9NXF7 216 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CELA3BP08861 270 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PARLQ9H300 379 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 A6NDN8 102 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 C17orf98A8MV24 154 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 IL4P05112 153 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CD99P14209 185 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RNFT1Q5M7Z0 435 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF841Q6ZN19 808 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NCOR1O75376 2440 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF383Q8NA42 475 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AUP1Q9Y679 476 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CGB1A6NKQ9 187 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PROB1E7EW31 1015 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PKIAP61925 76 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZP1P60852 638 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ESPL1Q14674 2120 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CBY3A6NI87 242 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPOP30536 169 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 OR4A47Q6IF82 309 aa13.4□□□□□ -0.26
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