RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CLDN18P56856 261 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 PNKDQ8N490 385 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 C17orf98A8MV24 154 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 TBX15Q96SF7 602 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNL4K9M1U5 179 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF222A6NCQ9 220 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM186Q96B77 213 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 NABP2Q9BQ15 211 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PARLQ9H300 379 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 LYZL4Q96KX0 146 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MED13LQ71F56 2210 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RRHO14718 337 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 GFI1Q99684 422 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 DIRC3C9JPN6 131 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 AGAP20933 346 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A28Q96A46 364 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 CA2P00918 260 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PPOXP50336 477 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 STPG3Q8N7X2 389 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PINLYPA6NC86 204 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 DOCK7Q96N67 2140 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 LIPFP07098 398 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TCTAP57738 103 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PAFAH1B2P68402 229 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM189A5PLL7 270 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 B9A039 149 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 CD81P60033 236 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 SPSB4Q96A44 273 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MFAP4P55083 255 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 GFRA1P56159 465 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 OR51M1Q9H341 326 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 CHODLQ9H9P2 273 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF146Q15072 292 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf92Q96LL3 132 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MOSP00540 346 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MT-ND6P03923 174 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 CEACAM1P13688 526 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TWIST1Q15672 202 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 USF3Q68DE3 2245 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00271P0C7V0 271 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.083e-15■■□□□ 13.2
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 BSPH1Q075Z2 132 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM177Q53S58 311 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms