RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL2L11O43521 198 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 P0C879 139 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDPNQ86YL7 162 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFHR4Q92496 578 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGT1Q9H0U3 335 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0U1RQK1 487 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 HKR1P10072 659 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRASP10301 218 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL12P30050 165 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF767PQ75MW2 155 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 NANPQ8TBE9 248 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 R3HDM4Q96D70 268 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 MARCH11A6NNE9 402 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSSCA1O60232 199 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 FSHBP01225 129 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD24P25063 80 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB13P51153 203 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF680Q8NEM1 530 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 C11orf1Q9H5F2 150 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 COA4Q9NYJ1 87 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFDP00746 253 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 P2RY1P47900 373 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC51BQ86UW2 128 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 RITA1Q96K30 269 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMR3AQ99954 134 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARPC5LQ9BPX5 153 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP50Q9UKX7 468 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 WRBO00258 174 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSX9Q7RTT3 188 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4C13Q8NGP0 309 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHOXO15266 292 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD1BP29016 333 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM177Q53S58 311 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 VENTXO95231 258 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 NQO2P16083 231 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS16P62249 146 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 HARBI1Q96MB7 349 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACANP16112 2415 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHST1O43916 411 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV1D-33P01593 117 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV1-33P01594 117 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 VAMP2P63027 116 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 C22orf15Q8WYQ4 148 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNA7P01567 189 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 BPIFB3P59826 476 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVK-16P61578 105 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBLN7Q53RD9 439 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL17RELQ6ZVW7 336 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHOVQ96L33 236 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR137BO60478 399 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPDEFO95238 335 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRASP01112 189 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGDIBP52566 201 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM120AOSQ5T036 256 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEGF9Q9H1U4 602 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBA52P62987 128 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM90A26D6RGX4 464 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 HES1Q14469 280 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNF4GQ14541 408 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2C3Q8N628 320 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNGR2O43760 224 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM50AO95807 157 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBP1P09467 338 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR9G9P0C7N8 305 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNTFRP26992 372 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 BRS3P32247 399 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAV2P51636 162 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST8SIA2Q92186 375 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM140Q9NV12 185 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBQLN2Q9UHD9 624 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM24AA6NFZ4 105 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLV2-23P01705 113 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 POU2AF1Q16633 256 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4A47Q6IF82 309 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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