RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR10D3Q8NH80 312 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CLDND2Q8NHS1 167 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAB2BQ8WUD1 216 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANKRD7Q92527 254 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNFRSF14Q92956 283 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BORCS7Q96B45 105 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMIM19Q96E16 107 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DIRAS2Q96HU8 199 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BTF3L4Q96K17 158 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCL13Q99616 98 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC22A4Q9H015 551 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C11orf1Q9H5F2 150 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TREM1Q9NP99 234 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NIT2Q9NQR4 276 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TAS2R4Q9NYW5 299 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C3orf18Q9UK00 162 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRELID1Q9Y255 219 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNF11Q9Y3C5 154 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CACNA1GO43497 2377 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KDM5BQ9UGL1 1544 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPATQ14207 1427 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIF27Q86VH2 1401 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTTNQ86VV8 2226 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MIA3Q5JRA6 1907 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1B0GVG6 124 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PQLC2LA1A4F0 135 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C7orf71A4D174 169 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM159BA6NKW6 160 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR4C45A6NMZ5 311 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C9JCJ5 164 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GOLGA8KD6RF30 607 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H3BT86 120 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 I3L521 148 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BIRC5O15392 142 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COCHO43405 550 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FADS1O60427 444 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 APOMO95445 188 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ASS1P00966 412 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRM2P04554 102 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ISG15P05161 165 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GP1BAP07359 652 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBP1P09455 135 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ASAH2BP0C7U1 165 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC35E2BP0CK96 405 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CGB7P0DN87 165 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FGF6P10767 208 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COX6A1P12074 109 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 M6PRP20645 277 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CASP1P29466 404 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MIPP30301 263 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SULT1A1P50225 295 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDK9P50750 372 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAB4BP61018 213 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPS24P62847 133 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COQ5Q5HYK3 327 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LGALS9CQ6DKI2 356 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LRRN1Q6UXK5 716 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM151BQ6UXP7 276 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 Q6ZRU5 148 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 Q6ZT83 130 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TEN1Q86WV5 123 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DHFR2Q86XF0 187 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GKN2Q86XP6 184 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM19A2Q8N3H0 131 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR7G1Q8NGA0 311 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR1M1Q8NGA1 313 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR1L8Q8NGR8 309 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR2T27Q8NH04 317 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR10AC1Q8NH08 325 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM172AQ8WUF8 416 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CANT1Q8WVQ1 401 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ASB13Q8WXK3 278 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DNAJC9Q8WXX5 260 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms