RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 I3L521 148 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SOX15O60248 233 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 B3GALNT1O75752 331 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RAB3DO95716 219 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PMP2P02689 132 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 FCER2P06734 321 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR8U8P0C7N1 319 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 AKAIN1P0CW23 69 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PTHLHP12272 177 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RFX2P48378 723 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 INPP1P49441 399 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 UCP3P55916 312 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 FXYD4P59646 89 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 GNB1P62873 340 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF616Q08AN1 781 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC190Q86UF4 302 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N402 240 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 BVESQ8NE79 360 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 LFNGQ8NES3 379 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SOSTQ9BQB4 213 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 KLK11Q9UBX7 282 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00473A8K010 186 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 GPR31O00270 319 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SHOXO15266 292 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ATG12O94817 140 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CNIH1O95406 144 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 HRASP01112 189 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV2-23P01705 113 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CD74P04233 296 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CD3DP04234 171 aa5.94□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 FXYD3Q14802 87 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM177Q53S58 311 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TRIQKQ629K1 86 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TERB2Q8NHR7 220 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 S100ZQ8WXG8 99 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DDB2Q92466 427 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TNCP24821 2201 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.93□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 J3QRK9 145 aa5.93□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 ACTL6BO94805 426 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CRYZL1O95825 349 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CRYGBP07316 175 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 FGF2P09038 288 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PGAM2P15259 253 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RPA2P15927 270 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R31P59538 309 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2KP61086 200 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-16P61578 105 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD4AQ8N468 514 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TEX45Q8NA69 505 aa5.93□□□□□ -1.46
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