RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 AGMATQ9BSE5 352 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PRORYQ9H606 182 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TCF19Q9Y242 345 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SLC25A6P12236 298 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 BTNL8Q6UX41 500 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 MISP3Q96FF7 219 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 JKAMPQ9P055 326 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CFHR2P36980 270 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RAB13P51153 203 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LOXL3P58215 753 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ARL16Q0P5N6 197 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 MMDQ15546 238 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 GUK1Q16774 197 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OR9G1Q8NH87 305 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IL22RA2Q969J5 263 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 FBP1P09467 338 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C4orf17Q53FE4 359 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ZNF787Q6DD87 383 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 OPRK1P41145 380 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 NDUFA2O43678 99 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PROP1O75360 226 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SFTA3P0C7M3 94 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 IL15RAQ13261 267 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PEA15Q15121 130 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RARRES2Q99969 163 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 S4R3C0 116 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ITPR1Q14643 2758 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 NPY1RP25929 384 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RAB31Q13636 194 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 MST1LQ2TV78 715 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 HEPN1Q6WQI6 88 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 ACANP16112 2415 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RRHO14718 337 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 PITX3O75364 302 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 TFF3Q07654 80 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 VSIRQ9H7M9 311 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 LIPFP07098 398 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 SULT1A2P50226 295 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 GUCA2BQ16661 112 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 FBXL15Q9H469 300 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 RPRMQ9NS64 109 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.52□□□□□ -0.88
HPS1-204ENST00000361490 MTORP42345 2549 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MMP26Q9NRE1 261 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MIOXQ9UGB7 285 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 A0A0U1RQK1 487 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 SEC11BP0C7V7 166 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CT45A6P0DMU7 189 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CT45A5P0DMU8 189 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CT45A7P0DMV0 189 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 HNF1AP20823 631 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 PAX9P55771 341 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 MLANAQ16655 118 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 SMUG1Q53HV7 270 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 UMAD1C9J7I0 102 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 F2RL2O00254 374 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 OR5G3P0C626 314 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-204ENST00000361490 CCL20P78556 96 aa9.51□□□□□ -0.89
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