RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 AARDQ4LEZ3 155 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4X1Q8NH49 305 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 R3HDM4Q96D70 268 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 CCKARP32238 428 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 MZT1Q08AG7 82 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB24Q969Q5 203 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 C15orf62A8K5M9 175 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 OR9G9P0C7N8 305 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 GZMHP20718 246 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51G1Q8NGK1 321 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 MANBALQ9NQG1 85 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 SRRM5B3KS81 715 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 CR1LQ2VPA4 569 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8N7P7 452 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF709Q8N972 641 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR12P47775 334 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 MORN2Q502X0 79 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A1Q86YD7 464 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX22Q96L94 193 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 HIST1H2BLQ99880 126 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 K7ENP7 123 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-201ENST00000357436 PRRG2O14669 202 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CFHR2P36980 270 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TDGF1P3P51864 188 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TLE1Q04724 770 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 PARLQ9H300 379 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 JPT1Q9UK76 154 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MXE2 369 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYAAP02489 173 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DIRC2Q96SL1 478 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF16Q9NXF7 216 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 FCGR3BO75015 233 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 HPRT1P00492 218 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SELLP14151 372 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 GNG12Q9UBI6 72 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 YPEL1O60688 119 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 GAMTQ14353 236 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4F5Q8NH21 305 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 YPEL2Q96QA6 119 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4F4Q96R69 305 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 MGST3O14880 152 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 LOXL3P58215 753 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8TCH9 128 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 H7BYZ3 331 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 LY86O95711 162 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFA6Q01524 100 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2V2Q96R30 315 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ACACBO00763 2458 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 PAGE4O60829 102 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFA4P12838 97 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CD1BP29016 333 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMP3P35625 211 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 GALR1P47211 349 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SPCS3P61009 180 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 F2RL2O00254 374 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF134P52741 427 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 MED13LQ71F56 2210 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R1X1 148 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 NECAP1Q8NC96 275 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R35Q8TAP8 253 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5B12Q96R08 314 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 GAB2Q9UQC2 676 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SMCO3A2RU48 225 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP1-201ENST00000357436 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms