RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LMO4P61968 165 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 HBG1P69891 147 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 HBG2P69892 147 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 AARDQ4LEZ3 155 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PDPNQ86YL7 162 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 PNKDQ8N490 385 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 DTD1Q8TEA8 209 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RPEQ96AT9 228 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 NABP2Q9BQ15 211 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RBKSQ9H477 322 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.21□□□□□ -1.09
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RABGGTB-201ENST00000319942 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 RELNP78509 3460 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V1G1O75348 118 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 DFFBO76075 338 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 CST7O76096 145 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR1DP28221 377 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 REG1BP48304 166 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 A8MXK9 166 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 MOB3BQ86TA1 216 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N7P7 452 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4A5Q8NH83 315 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 HARBI1Q96MB7 349 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF5Q99942 180 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 BET1LQ9NYM9 111 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP6Q13023 2319 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00862A6NCI5 91 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 KBTBD11O94819 623 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 FGF2P09038 288 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC11BP0C7V7 166 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A1P23297 94 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNLT3P51808 116 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 CLINT1Q14677 625 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 MLANAQ16655 118 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC1Q9HC57 220 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.19□□□□□ -1.1
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