RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 NPBWR2P48146 333 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 RUNX1Q01196 453 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 NECAP1Q8NC96 275 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SLC35E1Q96K37 410 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TP53RKQ96S44 253 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 IMMP2LQ96T52 175 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LIME1Q9H400 295 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.49□□□□□ -1.05
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GINS3-201ENST00000318129 RHBDL1O75783 438 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 OMGP23515 440 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 GALR1P47211 349 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ERVK11-1P61568 191 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 RANP62826 216 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MPV17LQ2QL34 196 aa8.48□□□□□ -1.05
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GINS3-201ENST00000318129 WDR82Q6UXN9 313 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LGI3Q8N145 548 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.48□□□□□ -1.05
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GINS3-201ENST00000318129 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 P2RX4Q99571 388 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PECRQ9BY49 303 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 RBKSQ9H477 322 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 Q9N2K0 584 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PN81 502 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZFP92A6NM28 416 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 NDUFB8O95169 186 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TYMSP04818 313 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 CHRNA7P36544 502 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PPOXP50336 477 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PTTG1IPP53801 180 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SVIPQ8NHG7 77 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 Q8TCH9 128 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SERPINE3A8MV23 424 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 NUPR1O60356 82 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 HRASP01112 189 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM11P17152 192 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.47□□□□□ -1.05
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GINS3-201ENST00000318129 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.47□□□□□ -1.05
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GINS3-201ENST00000318129 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 NAT8Q9UHE5 227 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LRRC30A6NM36 301 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 H7BYZ3 331 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 DYNLT3P51808 116 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TAS2R30P59541 319 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ADIRFQ15847 76 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 DTX2Q86UW9 622 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LRRC29Q8WV35 223 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZNF488Q96MN9 340 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 HES4Q9HCC6 221 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 GCM1Q9NP62 436 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 RNF7Q9UBF6 113 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZNF728P0DKX0 622 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 UCP3P55916 312 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 BSXQ3C1V8 233 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 PIGYQ3MUY2 71 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 LYG1Q8N1E2 194 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 SRRM5B3KS81 715 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 SH2D1BO14796 132 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 PDCD6O75340 191 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-201ENST00000318129 LHBP01229 141 aa8.45□□□□□ -1.06
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