RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.01□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.01□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.01□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 SGK494Q96LW2 274 aa9.01□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TP53RKQ96S44 253 aa9.01□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 F12P00748 615 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MELTFP08582 738 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 DLK1P80370 383 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 GGNQ86UU5 652 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 GBGT1Q8N5D6 347 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TMEM116Q8NCL8 245 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 ZNF319Q9P2F9 582 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MOSP00540 346 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 LRP11Q86VZ4 500 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 SEC11CQ9BY50 192 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TUBD1Q9UJT1 453 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 A0A0G2JK05 382 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 A0A1W2PRX2 142 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 IL4P05112 153 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PGA5P0DJD9 388 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 NPPCP23582 126 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TIMP3P35625 211 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 HIST3H3Q16695 136 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 WDR73Q6P4I2 378 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 NDUFB4O95168 129 aa9□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 THBDP07204 575 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 RRN3P1Q2M238 152 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 ANK1P16157 1881 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 C17orf98A8MV24 154 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 H3BQ15 152 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CRISP2P16562 243 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 LYPD3O95274 346 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 IGHV3-11P01762 117 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MMP9P14780 707 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CXCL2P19875 107 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 IER3P46695 156 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 NUP37Q8NFH4 326 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 VWA8A3KMH1 1905 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TM4SF5O14894 197 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 G0S2P27469 103 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MFAP2P55001 183 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 WDR82Q6UXN9 313 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.99□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 IL22RA2Q969J5 263 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 RAB24Q969Q5 203 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PRR32B1ATL7 298 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 BCL2P10415 239 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CD81P60033 236 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 ZNF345Q14585 488 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 UCP3P55916 312 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 TMEM187Q14656 261 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 Q6ZS92 163 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 DUX5Q96PT3 197 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CA2P00918 260 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 ZNF250P15622 560 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PMS2P11Q13670 270 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 MDS2Q8NDY4 140 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.98□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 RLFQ13129 1914 aa8.97□□□□□ -0.97
TMX3-201ENST00000299608 H2BFSP57053 126 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms