RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 DCUN1D4Q92564 292 aa16.66■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 RITA1Q96K30 269 aa16.66■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.66■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAV3A0A0B4J244 114 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 C15orf61A6NNL5 157 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 KBTBD11O94819 623 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MOSP00540 346 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 LYL1P12980 280 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2KP61086 200 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM65Q6PI78 240 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPB7Q9UBY9 170 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.65■□□□□ 0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SSSCA1O60232 199 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFRSF9Q07011 255 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HES1Q14469 280 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 AARDQ4LEZ3 155 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4A5Q8NH83 315 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.64■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 E5RGE8 158 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 UPK2O00526 184 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A17O43808 307 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 BPIFB3P59826 476 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF429Q86V71 674 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PRNDQ9UKY0 176 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM96BQ9Y3D0 163 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0U1RQK1 487 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNGR2O43760 224 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MED6O75586 246 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CD24P25063 80 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM14BQ9NUH8 114 aa16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SPDEFO95238 335 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM106CPP0CH98 169 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HNF4GQ14541 408 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX45Q8NA69 505 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NANPQ8TBE9 248 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MFFQ9GZY8 342 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPB11Q9Y547 144 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.62■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 L7N2F9 121 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CHST1O43916 411 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNA17P01571 189 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTFRP26992 372 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL8P62917 257 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 VAMP2P63027 116 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 EBI3Q14213 229 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PSG5Q15238 335 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MMDQ15546 238 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 OR52E5Q8NH55 327 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB40CQ96S21 281 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP50Q9UKX7 468 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FBP1P09467 338 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SPCS3P61009 180 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RBKSQ9H477 322 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.61■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NBR2O15453 112 aa16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF345Q14585 488 aa16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TNCP24821 2201 aa16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNAB3O43448 404 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FSHBP01225 129 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FGF2P09038 288 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM11P17152 192 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCL2P19875 107 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 P2RY1P47900 373 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 DYNLT3P51808 116 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1456Q9P272 454 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF222A6NCQ9 220 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16.59■□□□□ 0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RRHO14718 337 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms