RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 SCTP09683 121 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UBBP0CG47 229 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 HSMCR30P0CW71 290 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ETV1P50549 477 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MFAP2P55001 183 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 HLA-DRB3P79483 266 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RTL8BQ17RB0 113 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.67□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TSPAN4O14817 238 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 GSTT2P0CG29 244 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 GSTT2BP0CG30 244 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MYOD1P15172 320 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ADMP35318 185 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SSX1Q16384 188 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ZNF585BQ52M93 769 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 SSR3Q9UNL2 185 aa7.66□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PKD1P98161 4303 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MPTX1A8MV57 137 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RTL8CO15255 209 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 GADD45AP24522 165 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 MMD2Q8IY49 270 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CCDC140Q96MF4 163 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TM2D1Q9BX74 207 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 CSTL1Q9H114 145 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 HRH4Q9H3N8 390 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 RDH8Q9NYR8 311 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.65□□□□□ -1.18
USP41-201ENST00000292729 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 OR4C46A6NHA9 309 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 DHFRP00374 187 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 PSMB6P28072 239 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 HTR2CP28335 458 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 VBP1P61758 197 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 NCS1P62166 190 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 SPCS2Q15005 226 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 CDK10Q15131 360 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 OR11H2Q8NH07 326 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 S100ZQ8WXG8 99 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 PHYHIPQ92561 330 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 OR2D2Q9H210 308 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 Q9N2K0 584 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.64□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 A0A1W2PPK0 400 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 TMEM127O75204 238 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 IGHV3-23P01764 117 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 SRMP19623 302 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 KLK9Q2XQG4 91 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 OR4A5Q8NH83 315 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 CXorf58Q96LI9 332 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 OR51E2Q9H255 320 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.63□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.62□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.62□□□□□ -1.19
USP41-201ENST00000292729 TRDCB7Z8K6 153 aa7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms