RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 SSTR5P35346 364 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 GFRA1P56159 465 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT14Q96FL9 552 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 PLAUP00749 431 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 MGPP08493 103 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF343Q6P1L6 599 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 MYO7BQ6PIF6 2116 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 RHBDL1O75783 438 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 LEAP2Q969E1 77 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 GUCD1Q96NT3 240 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ABCA1O95477 2261 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 A0A087X0M5 115 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1B0GX30 115 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM189A5PLL7 270 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 EFNA2O43921 213 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 DANCRP0C864 163 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF146Q15072 292 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 TP53RKQ96S44 253 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 PPOXP50336 477 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 C12orf77C9JDV5 145 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 RND3P61587 244 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 C16orf92Q96LL3 132 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 HSPB7Q9UBY9 170 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 WNT9BO14905 357 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ATP5J2P56134 94 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 FAM27E3Q08E93 113 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRS-201ENST00000262963 FOXH1O75593 365 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 HLA-DQA1P01909 254 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 UCP1P25874 307 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 SPSB4Q96A44 273 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 FER1L5A0AVI2 2057 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN18P56856 261 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 ABCA4P78363 2273 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 RAB9AP51151 201 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 H0YL77 283 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 CLPSP04118 112 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 PSG7Q13046 419 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 PNKDQ8N490 385 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 UTRNP46939 3433 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 PDLIM4P50479 330 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 PLAURQ03405 335 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 OR10S1Q8NGN2 331 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 CADP27708 2225 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 CXorf65A6NEN9 183 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 TM4SF5O14894 197 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 TM4SF20Q53R12 229 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 FAM57AQ8TBR7 257 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 NABP2Q9BQ15 211 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 OR51M1Q9H341 326 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 MAS1LP35410 378 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 FANCMQ8IYD8 2048 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 M0QZK8 103 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 MDKP21741 143 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM105Q8N8V8 129 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 LINC01560Q8TB33 94 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRS-201ENST00000262963 NPIPB3Q92617 1050 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms