RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PbkQ9JJ78 330 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scn2aA0A0J9YTW6 2006 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mpig6bD7PDD4 242 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mef2bO55087 349 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FblP35550 327 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cmc2Q8K199 79 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1271Q8VG62 305 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lamtor1Q9CQ22 161 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpx2Q9JHC0 190 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tln2Q71LX4 2375 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm29049A0A087WSM5 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnk15B2RVL1 343 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21118J3QPK8 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8677K9J7G9 307 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CapgP24452 352 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20909Q5FWB5 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20852Q5M8R5 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr323Q5NCD0 323 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20917Q62457 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20809Q62458 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20865Q62460 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bst1Q64277 311 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20738Q810R8 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcrl1Q8R4Y0 343 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20806Q9D9T3 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Enpp5Q9EQG7 477 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tagln2Q9WVA4 199 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NgfrQ9Z0W1 417 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1154L7MU57 310 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps10P63325 165 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defb4P82019 63 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem11Q8BK08 190 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1038Q8VGS1 319 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr638Q8VH20 321 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs21V9GXQ3 152 aa11.12□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp34G3UXG0 151 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21746J3QMM6 180 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabra6P16305 453 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtgirP43252 415 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem52bQ0VBF2 186 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tctn2Q2MV57 700 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thap4Q6P3Z3 569 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr94Q6UAH0 386 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1031Q7TR87 336 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stpg2Q8C8J0 561 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aqp3Q8R2N1 292 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rep15Q9D7T1 230 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11027G8JL69 66 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acyp2P56375 106 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbx6P70327 436 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sft2d1Q5SSN7 159 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Commd9Q8K2Q0 198 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NanpQ9CPT3 248 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ShpkQ9D5J6 476 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LexmA2AVQ5 414 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Meox1P32442 253 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fndc4Q3TR08 231 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr901Q7TRD1 311 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BambiQ9D0L6 260 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slurp1Q9Z0K7 110 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r61W4VSP5 300 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dock11A2AF47 2073 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1329L7MTV4 313 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpsb2P21845 276 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkpd1Q0VF94 599 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MlanaQ2TA50 113 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr132Q7TRI8 313 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr837Q8VFJ4 312 aa11.11□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dock10Q8BZN6 2150 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr465-ps1A0A0U1RPZ4 315 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr282A1L1B4 308 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ascl5M0QWB7 188 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brs3O54798 399 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q0VG62 139 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem18Q3TUD9 140 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scarb1Q61009 509 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oxgr1Q6IYF8 337 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hif1anQ8BLR9 349 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nupl2Q8CIC2 420 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13762A2ATG2 311 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lbhd2G3UW55 114 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab33bO35963 229 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcpt8P43430 247 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccl11P48298 97 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcf15Q60756 195 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt9Q8BVU5 350 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wipi1Q8R3E3 446 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr95Q8VFE2 312 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr822Q8VFU1 312 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr76Q8VFV2 317 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St3gal6Q8VIB3 329 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem70Q921N7 253 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Flywch2Q9CQE9 139 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.2 ms