RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	G6PC	P35575	357 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	EFNB2	P52799	333 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SRY	Q05066	204 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP5G2	Q06055	141 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TESK1	Q15569	626 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		Q499Y3	187 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GJC3	Q8NFK1	279 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FNDC10	F2Z333	226 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FCN1	O00602	326 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TBL1X	O60907	577 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	LDB3	O75112	727 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CA2	P00918	260 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CXCL8	P10145	99 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL2	P10415	239 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A6	P12236	298 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MYBPH	Q13203	477 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF550	Q7Z398	422 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		Q96MF0	132 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0J9YW62	118 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PIN1P1	O15428	100 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MLNR	O43193	412 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TACSTD2	P09758	323 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SFTPD	P35247	375 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SSR4	P51571	173 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OOSP2	Q86WS3	158 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OR2M3	Q8NG83	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	OR10D3	Q8NH80	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	EFNA2	O43921	213 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GPX1	P07203	203 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	LEP	P41159	167 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SEC11A	P67812	179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF85	Q03923	595 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF90	Q03938	601 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	HES1	Q14469	280 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	LCN12	Q6JVE5	192 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SBSN	Q6UWP8	590 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	RARRES3	Q9UL19	164 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	hADV38S2	A0JD32	116 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM212	A6NML5	194 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		M0QZQ0	153 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DLL1	O00548	723 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DEDD	O75618	318 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF136	P52737	540 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PRORY	Q9H606	182 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	IL21	Q9HBE4	155 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0A6YYD5	115 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	SYNGR1	O43759	233 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLL1	P15814	213 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	CA7	P43166	264 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	TCF23	Q7RTU1	214 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	KLK6	Q92876	244 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MYO9B	Q13459	2157 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	LMO7DN	F2Z398	122 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	RUNX3	Q13761	415 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NECAP1-222	ENST00000640072	MOB3B	Q86TA1	216 aa		5.17	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms