RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	CLN5	O75503	358 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	LOXL3	P58215	753 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR4F5	Q8NH21	305 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	APC2	O95996	2303 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GLRX	P35754	106 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	P2RX4	Q99571	388 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	DSCAM	O60469	2012 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TM4SF5	O14894	197 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HPRT1	P00492	218 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PSMB3	P49720	205 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	NECAP1	Q8NC96	275 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	S1PR3	Q99500	378 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	DOK5	Q9P104	306 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN34	H7C241	214 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	KLK10	O43240	276 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PAGE4	O60829	102 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CD1B	P29016	333 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152		B4DEV8	164 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RRH	O14718	337 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	YPEL1	O60688	119 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK-16	P61578	105 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RHOV	Q96L33	236 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SDSL	Q96GA7	329 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MB	P02144	154 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GNG10	P50151	68 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2G2	P60604	165 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GNB2	P62879	340 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	DEFA6	Q01524	100 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RTP5	Q14D33	572 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZS92	163 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CCL13	Q99616	98 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRB	P23467	1997 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PAX5	Q02548	391 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PARL	Q9H300	379 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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