RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DUSP13Q9UII6 198 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 RRHO14718 337 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 MBP02144 154 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GYPAP02724 150 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CD82P27701 267 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5G3P48201 142 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 P2RY6Q15077 328 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DERL1Q9BUN8 251 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CRYAAP02489 173 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ADH4P08319 380 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SELLP14151 372 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GALR1P47211 349 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GPR12P47775 334 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GNB1P62873 340 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CR1LQ2VPA4 569 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GAB2Q9UQC2 676 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SPTBN2O15020 2390 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SPINT2O43291 252 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CD1BP29016 333 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 RELBQ01201 579 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 LEAP2Q969E1 77 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GCH1P30793 250 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TREML4Q6UXN2 200 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PIP4P1Q86T03 277 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF114Q8NC26 417 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DDB2Q92466 427 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 MGST2Q99735 147 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf94C9JXX5 98 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 M0R1X1 148 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 EDDM3BP56851 147 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 FAM201AQ5SY85 155 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TGOLN2O43493 480 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HRASP01112 189 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GAMTQ14353 236 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 JPT1Q9UK76 154 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CADP27708 2225 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 H7BYZ3 331 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 F2RL2O00254 374 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GFRA3O60609 400 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HPRT1P00492 218 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TUBG1P23258 451 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2G2P60604 165 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GNG12Q9UBI6 72 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 YPEL1O60688 119 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CGB3P0DN86 165 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 CGB7P0DN87 165 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 YPEL2Q96QA6 119 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TCF23Q7RTU1 214 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01551Q86U37 167 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF709Q8N972 641 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 OR2V2Q96R30 315 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 LHBP01229 141 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 AMBPP02760 352 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF83P51522 516 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 SPCS3P61009 180 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf170-201ENST00000623052 RAB1CQ92928 201 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms