RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 B9D2Q9BPU9 175 aa22.38■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R8Q9NYW2 309 aa22.38■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD34BA5PLL1 514 aa22.37■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 RPS19P39019 145 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 SECTM1Q8WVN6 248 aa22.37■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 AADACP22760 399 aa22.36■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK10Q15131 360 aa22.36■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 MEIS3P1A6NDR6 274 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 IGLV2-14P01704 120 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 CBX5P45973 191 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFA5Q01523 94 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD12Q8N8I0 201 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4S2Q8NH73 311 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 IFT46Q9NQC8 304 aa22.35■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 UBE2NLQ5JXB2 153 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf87Q6NUJ2 197 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 OVCH2Q7RTZ1 564 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 MMD2Q8IY49 270 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 MFSD4AQ8N468 514 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 OR13F1Q8NGS4 319 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4C12Q96R67 309 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 CCL28Q9NRJ3 127 aa22.34■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFSF12O43508 249 aa22.33■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 XRCC3O43542 346 aa22.33■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 FXYD4P59646 89 aa22.33■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF66Q6ZN08 573 aa22.33■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 GPHA2Q96T91 129 aa22.33■■□□□ 1.17
SEMA3B-215ENST00000621029 OR9G9P0C7N8 305 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ZP3P21754 424 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM69Q5SWH9 247 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ACSM6Q6P461 480 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SPIN2AQ99865 258 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ELOVL1Q9BW60 279 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC5A7Q9GZV3 580 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 PPYP01298 95 aa22.31■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2A4O95047 310 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 C10orf55Q5SWW7 151 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5AP2Q8NGF4 316 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 VSTM2AQ8TAG5 236 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SNAPC3Q92966 411 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 USMG5Q96IX5 58 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2A7Q96R45 310 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 RSRP1Q9BUV0 290 aa22.3■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 KIR2DS2P43631 304 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 BRI3O95415 125 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 HRASP01112 189 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SPNP16150 400 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R20P59543 309 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SSX9Q7RTT3 188 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM17Q86X19 198 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 PRH1P02810 166 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 HERV-K104P61576 105 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 NCS1P62166 190 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 DYRK1AQ13627 763 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 MSMO1Q15800 293 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SPAG16Q8N0X2 631 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB34Q8NCN2 500 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A46Q96AG3 418 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 EHFQ9NZC4 300 aa22.27■■□□□ 1.16
SEMA3B-215ENST00000621029 DPPA5A6NC42 116 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 KBTBD11O94819 623 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 VBP1P61758 197 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RHOGP84095 191 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 GIMAP1Q8WWP7 306 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 COMMD3Q9UBI1 195 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa22.26■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SULT1C2O00338 296 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 BRWD1-AS2P59051 145 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP5G2Q06055 141 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 CATR1Q13166 79 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF343Q6P1L6 599 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 HAPLN4Q86UW8 402 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A42Q86VD7 318 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 HMX3A6NHT5 357 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS3P35030 304 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 TATDN3Q17R31 274 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 ASCL2Q99929 193 aa22.24■■□□□ 1.15
SEMA3B-215ENST00000621029 AIFM2Q9BRQ8 373 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 421.3 ms