RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RNF150Q9ULK6 438 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TCF19Q9Y242 345 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RNF114Q9Y508 228 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PPI3 338 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 FGF16O43320 207 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SPDEFO95238 335 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1D-33P01593 117 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1-33P01594 117 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV4-59P01825 116 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ANXA3P12429 323 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 LGALS7P47929 136 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CD300CQ08708 224 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 BVESQ8NE79 360 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 NABP2Q9BQ15 211 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 H0YJW9 148 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 GPR137BO60478 399 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFB6O95139 128 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 HRASP01112 189 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TAS2R31P59538 309 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ERVK-16P61578 105 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PLGLAQ15195 96 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA5Q16718 116 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 B9D2Q9BPU9 175 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CHIAQ9BZP6 476 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.22□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 A6NDX4 124 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SHOXO15266 292 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ACTL6BO94805 426 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 C1QBP02746 253 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 IL5P05113 134 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SERPINE2P07093 398 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CT45A6P0DMU7 189 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CT45A5P0DMU8 189 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CT45A7P0DMV0 189 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RPA2P15927 270 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 GNRHRP30968 328 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CCR6P51684 374 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RND3P61587 244 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SRPXP78539 464 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 EBI3Q14213 229 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MMDQ15546 238 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 LY6EQ16553 131 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms