RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594387.1

IRF3-208, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 3

Gene IRF3, Length 800 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-208	ENST00000594387	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.49	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.49	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	LINC01619	G3V211	115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	SOX15	O60248	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	HRAS	P01112	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	APOA1	P02647	267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	TAS2R46	P59540	309 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	MSMO1	Q15800	293 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	PRSS8	Q16651	343 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	POC5	Q8NA72	575 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.48	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	INSL3	P51460	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	FHL3	Q13643	280 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	TNC	P24821	2201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	OVOL1	O14753	267 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	OR2A4	O95047	310 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.46	□□□□□ -0.25
IRF3-208	ENST00000594387	TNFSF12	O43508	249 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	PMP2	P02689	132 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	TSPAN5	P62079	268 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	RHOV	Q96L33	236 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	S100G	P29377	79 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	MAS1L	P35410	378 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ECI1	P42126	302 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	RFX2	P48378	723 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387		A0A087WW49	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	HPGDS	O60760	199 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	KBTBD11	O94819	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	GABARAP	O95166	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	APELA	P0DMC3	54 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ZP3	P21754	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387		K7EIL1	84 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SULT1C2	O00338	296 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26	1e-6	■□□□□ 9.8
IRF3-208	ENST00000594387	SAP30	O75446	220 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	BRI3	O95415	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	HPRT1	P00492	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	NAT1	P18440	290 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	ELK1	P19419	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IRF3-208	ENST00000594387	SLURP1	P55000	103 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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