RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CAV2P51636 162 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LMO4P61968 165 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 POU2AF1Q16633 256 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX261Q6UWH6 196 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2C3Q8N628 320 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5AN1Q8NGI8 311 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PHYHIPLQ96FC7 376 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 INSIG2Q9Y5U4 225 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 U3KQ87 197 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SHOXO15266 292 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 P0C879 139 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TPT1P13693 172 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS4P56470 323 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PNKDQ8N490 385 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OR52E5Q8NH55 327 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4A5Q8NH83 315 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PRNDQ9UKY0 176 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OTOGQ6ZRI0 2925 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 DOCK11Q5JSL3 2073 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CHST1O43916 411 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 JTBO76095 146 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ARG1P05089 322 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 HKR1P10072 659 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS7P47929 136 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LCN2P80188 198 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF9Q07011 255 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MINOS1Q5TGZ0 78 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM8Q96KF7 97 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOVQ96L33 236 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NABP2Q9BQ15 211 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM140Q9NV12 185 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 DPM3Q9P2X0 92 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP50Q9UKX7 468 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 VWC2LB2RUY7 222 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 H0YJW9 148 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA17P01571 189 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 BRWD1-AS2P59051 145 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SPCS3P61009 180 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2KP61086 200 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 IFITM2Q01629 132 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 VMA21Q3ZAQ7 101 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MIDNQ504T8 468 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM177Q53S58 311 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8H3Q8N146 312 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF5Q99942 180 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGT1Q9H0U3 335 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 LPAR2Q9HBW0 351 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ENY2Q9NPA8 101 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 APCP25054 2843 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JRQ6 117 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CEBPZOSA8MTT3 80 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TOX4O94842 621 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 HBG1P69891 147 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 HBG2P69892 147 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF429Q86V71 674 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF680Q8NEM1 530 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 HARBI1Q96MB7 349 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 HIPK2Q9H2X6 1198 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 FGF2P09038 288 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RIPPLY3P57055 190 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF266Q14584 549 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 VMO1Q7Z5L0 202 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N7P7 452 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 STOML3Q8TAV4 291 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 BET1LQ9NYM9 111 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PSENENQ9NZ42 101 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 DFFBO76075 338 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 AARDQ4LEZ3 155 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 UTF1Q5T230 341 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZRM9 215 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SSX9Q7RTT3 188 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 MOB3BQ86TA1 216 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC20Q8TCA0 184 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ST8SIA2Q92186 375 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SIRT7Q9NRC8 400 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 GATA3P23771 443 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 REG1BP48304 166 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-212ENST00000591041 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
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