RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 WBP1Q96G27 269 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMD4Q96H15 378 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NMES1Q9C002 83 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 AK3Q9UIJ7 227 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.35□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MED12LQ86YW9 2145 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV17A0A0B4J275 112 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5B21A6NL26 309 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LEUTXA8MZ59 168 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 BMPR1BO00238 502 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1D-12P01611 117 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CRHP06850 196 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMB6P28072 239 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CALCRP30988 508 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CCKARP32238 428 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HAAOP46952 286 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PLP1P60201 277 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF12P61328 243 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TGFBR3Q03167 851 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 BAMBIQ13145 260 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SMCO1Q147U7 214 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 AANATQ16613 207 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MPV17LQ2QL34 196 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGYQ3MUY2 71 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ELP2Q6IA86 826 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD1Q8N668 190 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP37Q8NFH4 326 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DCUN1D4Q92564 292 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC22AQ96IW7 307 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf50Q96LR7 162 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MED9Q9NWA0 146 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 STARD10Q9Y365 291 aa3.34□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ESPL1Q14674 2120 aa3.34□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC13O75165 2243 aa3.34□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.34□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.33□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CD300LBA8K4G0 201 aa3.33□□□□□ -1.88
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