RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583254.1

CTC1-211, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTC1, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-211ENST00000583254 IRF3Q14653 427 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 AWAT2Q6E213 333 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 Q6ZRM9 215 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CDH26Q8IXH8 852 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 GAPTQ8N292 157 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UFD1Q92890 307 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 GALNT14Q96FL9 552 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 RNF126Q9BV68 326 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 BANF2Q9H503 90 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 IL36GQ9NZH8 169 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MPTX1A8MV57 137 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MPPED1O15442 326 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 OR2J3O76001 311 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 IGLV2-23P01705 113 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SCTP09683 121 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SRMP19623 302 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CRHBPP24387 322 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 ARL3P36405 182 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 HTD2P86397 168 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 TPBGQ13641 420 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 ZNF124Q15973 351 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 C15orf32Q32M92 178 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 RAB12Q6IQ22 244 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 GPHB5Q86YW7 130 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 OR4A5Q8NH83 315 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CCDC140Q96MF4 163 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CSTL1Q9H114 145 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 Q9H521 79 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 RAB26Q9ULW5 256 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.11□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UBE2QL1A1L167 161 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 APOA2P02652 100 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CRYGBP07316 175 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MGMTP16455 207 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 TRAM1Q15629 374 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 ZNF585BQ52M93 769 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 OR10K2Q6IF99 312 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PDPNQ86YL7 162 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 ZNF383Q8NA42 475 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 Q8NAQ8 132 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PHYHIPQ92561 330 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 GALMQ96C23 342 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 C18orf15Q96N68 181 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MGLLQ99685 303 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 HRH4Q9H3N8 390 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 S4R3C0 116 aa5.1□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 TSPAN4O14817 238 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 PROP1O75360 226 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 SC5DO75845 299 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 ARL6IP5O75915 188 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 IFNA10P01566 189 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UCHL1P09936 223 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 UBBP0CG47 229 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 C8orf88P0DMB2 117 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 FUT3P21217 361 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 FABP5Q01469 135 aa5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CTC1-211ENST00000583254 P2RY14Q15391 338 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms